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| RUNX3 | Q13761 | AC068647.1-201 | ENST00000489539 | 2265 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRFN5-204 | ENST00000554171 | 4253 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5AC2-201 | ENST00000358642 | 930 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP197-201 | ENST00000363357 | 119 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | FBXO3-AS1-202 | ENST00000533046 | 386 nt | TSL 3 BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091515.1-201 | ENST00000548110 | 679 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC103858.2-201 | ENST00000621471 | 543 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | SCARNA4.1-201 | ENST00000628597 | 123 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6C71P-202 | ENST00000641886 | 1107 nt | BASIC | 3.45 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAPK10-253 | ENST00000641010 | 4072 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NCAPGP1-201 | ENST00000505112 | 1814 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DICER1-203 | ENST00000526495 | 10331 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAF7L-201 | ENST00000324762 | 2107 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM69A-202 | ENST00000613047 | 2646 nt | TSL 4 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DOCK7-204 | ENST00000454575 | 6985 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NPFFR2-203 | ENST00000358749 | 1559 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TAS2R20-201 | ENST00000538986 | 1381 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE2D2-201 | ENST00000253815 | 444 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL512646.1-201 | ENST00000269395 | 1077 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP235-201 | ENST00000365411 | 114 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-224P-201 | ENST00000384055 | 107 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL354733.1-203 | ENST00000417672 | 495 nt | TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | LINC01867-201 | ENST00000435357 | 604 nt | TSL 2 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | NAALADL2-AS3-202 | ENST00000453180 | 413 nt | TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OFD1P7Y-201 | ENST00000454643 | 1155 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC069444.1-201 | ENST00000489428 | 266 nt | TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093523.1-201 | ENST00000503268 | 499 nt | TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPL36-203 | ENST00000505818 | 595 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00977-201 | ENST00000509893 | 1163 nt | TSL 2 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FTH1P9-201 | ENST00000513251 | 355 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112196.1-201 | ENST00000515092 | 832 nt | TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD116-26-201 | ENST00000516006 | 96 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU1-103P-201 | ENST00000516502 | 125 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPS36P3-201 | ENST00000519284 | 130 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP006245.1-201 | ENST00000522549 | 120 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02442-202 | ENST00000540761 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008083.3-201 | ENST00000547777 | 329 nt | TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GLIPR1L1-204 | ENST00000548623 | 484 nt | TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009101.1-201 | ENST00000568135 | 242 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103808.1-201 | ENST00000579833 | 922 nt | TSL 3 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016493.1-201 | ENST00000586106 | 688 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCNAP1-202 | ENST00000595299 | 752 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590235.2-201 | ENST00000602641 | 632 nt | TSL 5 BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC107952.2-201 | ENST00000606048 | 486 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092106.3-201 | ENST00000611308 | 722 nt | BASIC | 3.44 | □□□□□ -1.86 | | |