Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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MKRN4PQ13434 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN4PQ13434 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
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