Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DUSP4Q13115 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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