Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
FOXD4Q12950 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
FOXD4Q12950 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms