Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXO1Q12778 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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FOXO1Q12778 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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FOXO1Q12778 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
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FOXO1Q12778 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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FOXO1Q12778 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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FOXO1Q12778 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXO1Q12778 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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