Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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