Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LRRTM2O43300 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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