Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NREPQ16612 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NREPQ16612 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NREPQ16612 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NREPQ16612 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NREPQ16612 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NREPQ16612 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NREPQ16612 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NREPQ16612 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NREPQ16612 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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