Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FXNQ16595 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms