Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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RPE65Q16518 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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RPE65Q16518 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RPE65Q16518 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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