Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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PTPRKQ15262 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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PTPRKQ15262 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRKQ15262 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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