Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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