Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ITGA9Q13797 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.8 ms