Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SF3B2Q13435 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms