Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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CHAF1BQ13112 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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CHAF1BQ13112 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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CHAF1BQ13112 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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