Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHD3Q12873 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CHD3Q12873 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CHD3Q12873 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHD3Q12873 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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