Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHRNEQ04844 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms