Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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LTBRP36941 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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LTBRP36941 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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LTBRP36941 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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LTBRP36941 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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LTBRP36941 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LTBRP36941 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
LTBRP36941 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
LTBRP36941 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
LTBRP36941 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
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LTBRP36941 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LTBRP36941 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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