Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CAPN6Q9Y6Q1 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CAPN6Q9Y6Q1 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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CAPN6Q9Y6Q1 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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CAPN6Q9Y6Q1 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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CAPN6Q9Y6Q1 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CAPN6Q9Y6Q1 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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