Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC6□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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USP35Q9P2H5 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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USP35Q9P2H5 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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USP35Q9P2H5 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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USP35Q9P2H5 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
USP35Q9P2H5 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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