Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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