Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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