Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
LAMA3Q16787 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
LAMA3Q16787 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms