Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
VPS72Q15906 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VPS72Q15906 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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