Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC85BQ15834 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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