Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HMGN3Q15651 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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