Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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