Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SKIV2LQ15477 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SKIV2LQ15477 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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