Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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