Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRKQ15262 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPRKQ15262 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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PTPRKQ15262 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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PTPRKQ15262 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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PTPRKQ15262 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PTPRKQ15262 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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