Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TRAM2Q15035 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms