Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
ITGB3BPQ13352 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ITGB3BPQ13352 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms