Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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ERCC8Q13216 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERCC8Q13216 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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