Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
BPTFQ12830 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BPTFQ12830 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms