Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
EPHB4P54760 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms