Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PGGT1BP53609 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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