Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD8P13378 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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