Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA2O43364 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXA2O43364 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms