Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
NRXN3Q9Y4C0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms