Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5oQ9DB20 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms