Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTNAP4Q9C0A0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.27■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTNAP4Q9C0A0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms