Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD5Q99666 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms