Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARXQ96QS3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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