Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM3

Ptpn7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn7Q8BUM3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptpn7Q8BUM3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms