Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT27Q7Z3Y8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms