Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms