Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM74A1Q5RGS3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms