Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERBB4Q15303 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms