Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTCH1Q13635 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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