Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATMQ13315 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATMQ13315 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATMQ13315 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATMQ13315 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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